仁济东院位于浦东陆家嘴金融贸易区内，1999年10月建成投入使用，占地86875平方米，建筑面积206859平方米。

仁济医院于1999年落户浦东，作为当时浦东新区唯一家三级甲等医院，为浦东地区居民和周边百姓获得优质医疗服务资源提供了切实的保障。随着浦东开发开放速度加快，浦东地区人口导入逐年增加，2011年常住人口超过500万。来院就诊病人快速攀升，至2012年日均病人流量超过8000人次，年门急诊量从57万人次递增到203万人次，对医院就医环境与服务空间都带来了巨大的压力和挑战。

为了满足日益增长的浦东居住人口医疗服务的需求，2005年仁济东院外科大楼建成并投入使用，核定床位1000张；2008年干部保健综合楼建成并投入使用；2008年12月仁济医院三期工程新门急诊医技综合楼作为上海市政府重大实事工程破土动工，2012年11月，仁济东院新门急诊大楼落成，总建筑面积5.95万平方米，比原先扩大3倍，在服务环境与诊疗设施等方面都得到很大的提升，为更多的病人获得优质医疗服务以及缓解群众看病就医困难做出更大的贡献。

作为上海市政府“5+3+1”重点项目，上海交通大学医学院附属仁济医院南院（下称“仁济南院”）自2012年12月12日全面开业，依托百年仁济优质医疗资源与深厚文化底蕴，以“名医战略、特色专科、优质服务、精细管理”为办院方针，以“让病员更满意，让员工更幸福”为服务宗旨。开业至今，医院总体运营安全、有序，各项业务指标稳步上升，在四家郊区新建三级医院中名列前茅。

医院总建筑面积8.2万平方米，由门诊楼、急诊医技楼、住院大楼、高压氧舱、地下停车库等组成；核定床位600张，先期开设消化科、风湿科、妇产科、泌尿科、神经外科、心内科、肾脏内科、普外科、骨科、儿科、血液科、血管外科、老年病科、神经内科、内分泌科、呼吸科、耳鼻咽喉头颈外科、急诊科、口腔科、中医科、眼科、皮肤科、胸外科、心血管外科、麻醉科、疼痛科、内科门诊等27个临床科室；药剂科、检验科、超声医学科、核医学科、病理科、放射科、输血科、高压氧、临床营养科等9个医技科室并全面开放门诊、急诊、病房、ICU；配置了64排的CT、3.0T的MR、以及DSA、SPECT、DR、钼靶、数字胃肠机、血液净化机等，尤其是配备了可容纳20座的大型高压氧舱，主舱16座，副舱4座，医疗设备配置完全达到三级综合性医院配置标准。

仁济西院地处上海市黄浦区中央商务区，毗邻外滩，目前占地面积为7811㎡，总建筑面积为31959㎡，开放床位共460张，年门诊量达79万人次，出院1.7万人次，手术1.1万例。

医院设有39个临床科室。在坚持强化老牌优势专科的同时，仁济西院不断探索多科协作与资源整合，努力发展新兴学科和亚专业。特色专科主要包括：消化内科、风湿病科、泌尿外科、功能神经科、妇科肿瘤科、头颈外科、产科、重症监护室（ICU）。

其中，消化内科是国家临床重点专科和上海市消化内科临床医学中心，精于消化道肿瘤和癌前疾病、幽门螺杆菌及其相关疾病、慢性肝病（肝纤维化和非病毒性肝病）的诊断和防治研究，年门急诊量居国内第一，总体处于国内领先地位，某些领域达国际先进水平。

2013年7月，以辅助生殖和优生技术而闻名的仁济医院生殖医学专科正式落户仁济医院北院（浦东新区灵山路845号）。

北院区占地10亩，建筑面积17500平方米，设有门诊、住院、手术室、遗传咨询室、医学影像室、辅助生殖实验室等科室，并按不同患者就医需求设立VIP服务和专门的病房，能开展所有不孕不育诊疗技术，为患者提供高质量的优生优育和辅助生殖医疗服务。

仁济医院是上海市最早开展辅助生殖技术临床及科研工作的医疗单位。1987年率先在上海地区开展人工授精技术服务；2004年成为上海市唯一一家被卫生部批准，可同时进行第一代、第二代试管婴儿和供精人工受精等辅助生殖技术的医疗机构；2009年牵头成立上海交通大学不孕不育专病诊治中心；2010年获准建设上海市生殖与优生优育技术中心；2012年成为上海市辅助生殖与优生重点实验室。目前，我国不孕不育占育龄夫妇的10%-15%。仁济医院生殖医学科不孕不育年门诊量超过12万人次，已实施“试管婴儿”和“人工授精”近两万例，帮助一万余对夫妇获得健康宝宝，辅助生殖技术达国内领先水平。

北院拥有上海市的人类精子库。该精子库是上海交通大学Med-X-仁济医院临床干细胞研究中心临床基地、是上海市分子男科学重点实验室临床基地；设有人类精子库实验室、上海男性健康俱乐部、上海男科学研究所精子发育与遗传实验室等。现任精子库主任为李铮教授。截至2013年11月，精子库已成功招募上万名捐献者，通过供精人工技术和体外受精技术已使2,998个不孕家庭获得天伦之乐。同时作为精子库重要特色之一，已为近千名男性提供精子冷冻保存。

仁济医院拥有一支强大的生殖医学专家队伍。现已形成以著名生殖医学专家陈子江教授为学科带头人，赵晓明、孙赟、洪燕、李铮、高玉平、高敏芝等为中坚力量的高层次专家队伍。一流的专家、一流的技术，将为广大不孕不育患者提供一流的服务，为人类的生殖健康事业做出重要贡献。